A religião legitimou a organização política e social incaica.

A religião inca dominante tinha como deus tutelar o Sol, chamado de Inti. Supostamente uma representação do Sol, sob a forma de deus Viracocha, havia aparecido em tempos muito antigos para trazer a civilização ao mundo. Fez o céu, a terra e uma geração de homens que pecou contra ele. Viracocha os transformou em pedras e criou mais tarde uma nova geração. Uma vez cumprida a sua missão, foi para o oeste, distanciando-se do mar.

O deus Sol proporcionava luz e calor e regia as estações do ano e o ciclo agrícola. O representante de Inti na terra era o Inca. Mama Quilla, a Lua, era a irmã e a esposa do Sol, e afetava o mundo feminino. Os templos que foram construídos para ela tinham suas paredes revestidas com folhas de prata.

Os incas acreditavam que as estrelas eram guardiões celestiais e que cada classe de animal e ave tinha sua própria estrela ou constelação. Os carroceiros de lhamas oravam à constelação da lhama que conhecemos como Lira. Nossa constelação, as Plêiades, era Collca para os incas, que significava armazém. Ela tinha a responsabilidade de preservar as sementes e era especialmente honrada.

As deusas femininas eram encarregadas de velar pela reprodução. Graças a elas, o mar e a terra, as duas maiores fontes esbanjadoras de recursos alimentícios eram de fecundidade inesgotável. Elas eram chamadas de Mama Cocha e Mama Pacha: mãe mar e mãe terra, respectivamente.